1、旷工一天扣三天薪资不合法。
2、旷工当天，用人单位可以不支付薪资，除了给用人单位造成了经济损失外，不得额外扣薪资的。
3、法律依据：
《中华人民共和国劳动法》第五十条薪资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的薪资。
《薪资支付暂行规章》第十六条规章，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的薪资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月薪资的20%。若扣除后的剩余薪资部分低于当地月最资标准，则按最资标准支付。